运用STRING在线数据库并结合Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互助(PPI)网络,筛选出最重要的基因模块及10个关键基因,利用Kaplan-Meier曲线分析预后,利用GEPIA和THPA在线数据库从基因和蛋白水平来验证分析关键基因与患者的预后关系。最后筛选到符合条件Etomoxir临床试验的4个肺腺癌关键基因 SPP1、TIMP1、MMP9、COL1A1。这4个基因可能成为肺腺癌预后潜在的生物标志物,并有可能成为治疗靶点和诊断靶标,对临床上肺腺癌的诊断和治疗有一定价值。
本文使用茴香霉素激活神经胶质瘤U251细胞内c-juncompound screening assay氨基末端激酶(JNK)活性,实现激活后的JNK对神经胶质瘤抑瘤效果的探究,并找到受JNK调节的关键转录因子。试验首先利用在线分析网站预测出受JNK调节的相关肿瘤模型,通过使用茴香霉素(JNK激动剂)实现对细胞内磷酸化JNK(P-JNK)水平的有效调EX-527节,并通过蛋白质印迹法(Western blot)探究其发挥作用的最适条件;然后通过Cell Counting Kit-8(CCK-8)检测、细胞计数、细胞划痕和流式细胞检测等试验,探究激活后的JNK对U251细胞的增殖、迁移能力以及细胞周期的影响;最后通过转录组测序(RNA-seq)技术分析找到受JNK调节的关键转录因子。