方法1.检索公共数据库中的肝癌基因组学数据集,选择纳入了2个肝癌数据集(n=547),并定义过氧化物酶体基因集;利用R语言及Bioconductor扩展包,采用生物信息学方法,对肝癌数据集的转录组学数据及临床信息进行预处理及后续分析;筛选具有预后价值的过氧化物酶体基因;分析预后相关的过氧化物酶体基因的差异表达情况;在TCGA肝癌数据VX-689订单集中从预后相关基因中应用LASSO算法筛选基因并建立预后模型;评估基因模型的预测效果及其独立性,并使用外部数据集验证;与其它肝癌基因预后模型对比,并联合临床特征优化预后模型。2.系统分析HAO2在大样本肝癌数据集中的表达变化情况及与肝癌预后的关系,采用临床标本验证HAO2的表达变化。采用GSEA分析探索HA获悉更多O2可能相关的KEGG通路。采用慢病毒感染构建HAO2稳定过表达的肝癌细胞株,Western blot及qPCR验证过表达效果;CCK8及流式细胞仪检测过表达HAO2对肝癌细胞增殖及细胞周期的影响;WB方法检测HAO2对细胞周期关键蛋白的影响;通过对HAO2过表达细胞进行转录组测序,分析下游可能的主要分子及时间机制;体外实验验证推测的分子机制。结果1.本研究共纳入2个HCC数据集的547例肝癌组织样本。其中训练集TCGA-LIHC包含351例,验证集LIRI-JP包含196例。定义了一个包含113个基因的过氧化物酶体基因集,预后分析发现47个过氧化物酶体基因与肝癌患者预后相关,部分基因同时表现出肝癌与癌旁组织的差异表达,多数为在肝癌中表达下降,其中HAO2为差异变化倍数最大的预后相关基因。