方法通过基因芯片我们分析了HCC组织和对应癌旁组织中的核RBPs表达水平,并发现核富集的RNA结合蛋白PTBP3在肝癌组织细胞核中表达水平最高。HCC细胞系转染PTBP3的siRNA或慢病毒载体,分析这些细胞的体外侵袭、迁移和增殖能力变化情况。同时,我们建立了三个体内模型裸鼠皮下植入肿瘤细胞模型、C57/BL小鼠肝原位模型、脾脏-肝脏转移模型分析PTBPProteases抑制剂3在体内对肝癌细胞增殖和转移能力的影响。为了鉴定PTBP3蛋白直接募集的lncRNAs,本研究行RNA免疫共沉淀(RNA immunoprecipitation,RIP)后测序,发现PTBP3蛋白可以募集细胞核富集转录因子1,NEAT1。荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH确认细节)和qRT-PCR分析验证了测序结果。并通过RIP,FISH和qRT-PCR评估剪变体。结果基于基因表达水平,PTBP3在HCC细胞的核中表达量最高。PTBP3在体外和体内均促进HCC细胞增殖和转移能力。RIP,FISH和qRT-PCR分析证实PTBP3蛋白在细胞核中募集了丰富的lnc-NEAT1剪变体(NEAT1_1和NEATLY3039478花费1_2)和pre-miR-612(miR-612的前体RNA)。PTBP3的表达水平直接决定了NEAT1_1,NEAT1_2和miR-612的表达水平。相关性分析显示PTBP3与NEAT1呈正相关,但与miR-612呈负相关。NEAT1和miR-612分别可以调控P53/CCND1和AKT2/EMT转录途径。PTBP3~(high)和NEAT1~(high)/miR-612~(low)患者的总生存期更短。