基于代谢组的全基因组关联分析(metabolome-based genome-wide association study,mGW

基于代谢组的全基因组关联分析(metabolome-based genome-wide association study,mGWAS)是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种方法。本文就近几年利用mGWAS技术在植物代谢调控网络研究、初生和次生代谢物的形成机制、代谢物在植物生长发育和胁迫应答中的作用进行了概述。同时综述了mGWAS在代谢物相关候选基因Selleckchem MK-4827的定位和调控营养、品质相关代谢通路的挖掘,为深入了解植物代谢物合成调控的遗传机制奠定基础。
胰岛素样生长因子结合蛋白(Insulin-like Growth Factor Binding Proteins,IGFBPs)与动物的生长发育有密切的联系。为了探讨IGFBP-3基因作为绵羊屠宰性状候选基因的可能性,本研究采用单链构象多态selleck化学药品性(Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism,PCR-SSCP)结合测序方法检测592只甘肃高山细毛羊IGFBP-3基因的变异特征,并分析核苷酸变异与屠宰性状的相关性。结果表明,绵羊IGFBP-3第4外显子区检测到1个单核苷酸变异位点(g.87 A>C寻找更多),A和B 2个等位基因(等位基因频率 56.76%和43.24%),表现为AA、AB和BB 3种基因型(基因型频率 29.73%,54.05%和16.22%),并且所研究的群体在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。相关性结果表明,甘肃高山细毛羊IGFBP-3基因g.87 A>C处的变异对宰前活质量、热胴体质量有极显著影响(P<0.01);对眼肌面积、GR值、嫩度有显著影响(P<0.05)。

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